实验室现有31位研究人员和10位技术管理人员；在读研究生和博士后78人，已成为我国系统与进化生物学研究领域的重要研究力量，同时也是国际上该领域有影响的实验室之一。

　　发展目标：选择该领域的重大基础理论问题，瞄准国家目标，重点研究植物物种多样性的形成和发展，重建植物的系统发育，探讨生物进化的过程和机制，取得具有国际影响的原创性和前瞻性研究成果，培养高层次人才；为生物多样性保护和可持续利用，为作物的遗传改良提供雄厚的理论基础，成为我国生物资源基础研究的中心。力争在10年内建成为国际该领域一流的实验室。

　　研究特色：系统与进化植物学是宏观生物学与微观生物学融合的综合研究的领域，本室的研究范围从古到今，从宏观到微观，有装备精良的专业实验室，有条件完备的植物标本馆和古植物馆，更有高水平的研究队伍，这样的实验室在世界上是独特的。在该实验室内，可以开展学科交叉融合，对理论问题进行综合研究， 对重大科学问题进行联合攻关。

　　科研设施：实验室下辖结构植物学室、细胞学室、生化室、分子室、实验温室和暗室等专业实验室，拥有扫描电子显微镜、荧光万能显微镜、激光共聚焦显微镜、全自动DNA测序仪等一系列大型先进仪器设备。

　　现任学术委员会主任：洪德元院士；实验室主任： 葛颂研究员。

　　目前，本实验室有以下9个创新研究组和1个责任研究组：

　　基因、染色体和基因组进化创新研究组

　　居群生物学和进化生物学创新研究组

　　植物系统发育重建创新研究组

　　物种多样性及其形成机制创新研究组

　　种子植物分类创新研究组

　　植被演替和环境演变创新研究组

　　演化植物学创新研究组

　　植物分子生物地理学创新研究组

　　进化与生态的基因组学创新研究组

　　植物系统发生与进化发育责任研究组

　　曾主持一系列国家和部委（科学院）的重要项目，目前正在主持的项目有：国家重点基础研究发展规划（973）项目（3000万元）1项；国家自然科学基金委创新群体科学基金（360万元）1项；国家自然科学基金委“九五”重点（100万）和“十五” 重点项目（105万）各1项；国家杰出青年科学基金（80万元）1项和海外杰出人才基金（80万元）2项；中国科学院“百人计划”项目（200万元）1项；中国科学院“十五”重要方向性项目（200万元及150万元）2项；中国科学院专项基金（60万元）1项。此外，正在主持的项目还有“863”专题、国家自然科学基金重大专题和面上基金等项目40余项，国际合作项目40余项等等。